Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4aQ8C9S8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Atg4aQ8C9S8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Atg4aQ8C9S8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Atg4aQ8C9S8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Atg4aQ8C9S8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Atg4aQ8C9S8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4aQ8C9S8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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