Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc159Q8C963 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc159Q8C963 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms