Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms