Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Srsf12Q8C8K3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Srsf12Q8C8K3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms