Protein–RNA interactions for Protein: Q8C627

Fam221b, Protein FAM221B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam221bQ8C627 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam221bQ8C627 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms