Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ska3Q8C263 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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