Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccser1Q8C0C4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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