Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
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Usp47Q8BY87 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Usp47Q8BY87 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Usp47Q8BY87 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Usp47Q8BY87 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp47Q8BY87 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Usp47Q8BY87 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Usp47Q8BY87 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Usp47Q8BY87 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Usp47Q8BY87 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Usp47Q8BY87 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Usp47Q8BY87 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp47Q8BY87 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms