Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trerf1Q8BXJ2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trerf1Q8BXJ2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trerf1Q8BXJ2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trerf1Q8BXJ2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trerf1Q8BXJ2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trerf1Q8BXJ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trerf1Q8BXJ2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trerf1Q8BXJ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms