Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cldn17Q8BXA6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cldn17Q8BXA6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn17Q8BXA6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms