Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ube3dQ8BX13 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ube3dQ8BX13 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ube3dQ8BX13 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ube3dQ8BX13 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ube3dQ8BX13 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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