Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Suds3Q8BR65 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Suds3Q8BR65 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms