Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bicd1Q8BR07 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bicd1Q8BR07 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms