Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BPC6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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