Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gga3Q8BMI3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms