Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp54Q8BL06 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms