Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Frmd4aQ8BIE6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms