Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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