Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH48

Ubap1, Ubiquitin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1Q8BH48 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ubap1Q8BH48 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ubap1Q8BH48 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubap1Q8BH48 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubap1Q8BH48 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubap1Q8BH48 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ubap1Q8BH48 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubap1Q8BH48 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubap1Q8BH48 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubap1Q8BH48 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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