Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atg4dQ8BGV9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg4dQ8BGV9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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