Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGP6

Slc25a40, Solute carrier family 25 member 40, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a40Q8BGP6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc25a40Q8BGP6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms