Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms