Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubash3bQ8BGG7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubash3bQ8BGG7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms