Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg4bQ8BGE6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4bQ8BGE6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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