Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc38a9Q8BGD6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms