Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG17

Nol12, Nucleolar protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol12Q8BG17 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nol12Q8BG17 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol12Q8BG17 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms