Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms