Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Acsm4Q80W40 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms