Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ell3Q80VR2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ell3Q80VR2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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