Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ttc29Q80VM3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ttc29Q80VM3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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