Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp8Q80U87 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp8Q80U87 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp8Q80U87 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp8Q80U87 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp8Q80U87 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp8Q80U87 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp8Q80U87 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp8Q80U87 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms