Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS8

Sel1l3, Protein sel-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l3Q80TS8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sel1l3Q80TS8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms