Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Clec18aQ7TSQ1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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