Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcdh8Q7TSK3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms