Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf516Q7TSH3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms