Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms