Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms