Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms