Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Actn1Q7TPR4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms