Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trappc6aQ78XR0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trappc6aQ78XR0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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