Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sys1Q78S06 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sys1Q78S06 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sys1Q78S06 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sys1Q78S06 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sys1Q78S06 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sys1Q78S06 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sys1Q78S06 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms