Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SpopQ6ZWS8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SpopQ6ZWS8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms