Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd3Q6ZQK0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd3Q6ZQK0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms