Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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