Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp8b3Q6UQ17 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms