Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GcsamQ6RFH4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GcsamQ6RFH4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms