Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd1Q6PIP5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms