Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scaf4Q6PFF0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms