Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rad54bQ6PFE3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms