Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms